第 114 期 2005-09-05

會議報導
「生物資訊在分子演化學上的應用」研討會

國家衛生研究院分子與基因醫學研究組於2005年7月11、12日假竹南院區第四、第九會議室,舉辦「生物資訊在分子演化學上的應用」研討會(Workshop on Bioinformatics Application in Molecular Evolution),邀請於日本 National Institute of Genetics/ Graduate University for Advanced Studies任職的Dr. Yoshio Tateno與Dr. Roberto A. Barrero來台舉辦研習會, 講述族群遺傳和分子演化的概念、並且介紹DNA Data Bank of Japan(DDBJ)於生物資訊資料搜尋之應用,吸引院內外50名同仁學者熱情參與,並引發踴躍的討論。

Dr. Tateno於1975年、78年分別在東京都立大學(Tokyo Metropolitan University)及德州大學(University of Texas)拿到博士學位後,後續於德州大學作博士後研究,並於1979年回日本RIKEN擔任物理化學研究所研究員,期間獲得日本Niwa Academic Prize學術大獎,隨後從1988年迄今擔任日本National Institute of Genetics/ Graduate University for Advanced studies教授一職,並曾經擔任Pennsylvania State University、Tsukuba University、Hiroshima City University、Tokyo Medical and Dental University、Gunma University、香港中文大學的訪問教授,致力於推廣分子遺傳與分子演化的教學與研究。Dr. Tateno此行對院內外同仁學者詳細解說突變(mutation)對演化的重要性、基因分子突變如何應用在物種演化分析上、以及演化分析重要的概念及工具,並以Dr. Tateno團隊研究成果為範例,利用glutatmin synthetase (GS)以及major histocompatibility complex(MHC)基因作為靈長類演化樹分析的實際應用,精確估算出人類與恆河猴的分歧點是在2.7到3千萬年前,此項研究成果發表已於1993年及2005年Proceedings of the National Academy of Sciences of USA期刊。

另外Dr. Tateno也邀請畢業於東京大學生物科學研究所(Graduate School of Biological Science,The University of Tokyo)、現亦任教於National Institute of Genetics/ Graduate University for Advanced studies的Dr. Barrero一同來台,解說DDBJ加入The International Nucleotide Sequence Database Collaboration(INSDC),成功結合DDBJ、GeneBank與EMBL之資料庫,並發展出資料相容性最佳的使用介面,如All-round Retrieval Sequence and Annotation System(ARSA)、Sequence Retrieval System(SRS)、Genomes TO Protein Structures and Functions(GTOP)、Human Full-length cDNA Annotation Invitational Database(H-Inv DB)。DDBJ亦鼓勵研究人員提供更多的基因資料,例如single nucleotide polymorphism(SNP)、expression profile、distinct un-translated regions等。研習會於7月12日下午安排實際上機操作的機會,參與之學員可根據Dr. Barrero提供之練習題熟悉DDBJ操作介面,Dr. Barrero亦當場替大家解答各種在使用上的疑難雜症,參與者深感獲益良多。
《文:張雅惠;攝影:陳相如》