第 254 期 2008-06-05

院務紀事
核酸定序核心實驗室簡介
DNA Sequencing Core Lab.

國衛院核酸定序核心實驗室自民國86年成立迄今,以提供「核酸定序服務」支援本院各研究單位相關研究發展為主,期能在最短時程,達成所預期的服務,提供必需之資源,促進本院相關研究發展之推動。

核酸定序核心實驗室現有設施與性能如下:

核酸定序分析儀 ABI PRISM® 3730 XL DNA Analyzer Sequencer
. Gel fill in capillary automatically
. Sample loading by electronic potential automatically
. 11 runs/ 96 samples/ day
. Phred Q20: 850 bases per read
. Maximum production: 897.6 kb per day

本核心實驗室之核酸定序分析儀(DNA Analyzer Sequencer)採用Applied Biosystems製造,核酸定序反應以Big Dye Terminator v3.1 Sequencing Kit進行,檢體再以ABI PRISM® 3730 XL DNA Analyzer Sequencer進行毛細管電泳分析。從送件到結果輸出平均約需二個工作天,工作天計算是以能實際上機器跑毛細管電泳計算。

服務項目包括:DNA定序、DNA定序問題解答、代客DNA sequencing及Genotyping上機、 Primer服務:限加T7、SP6、M13Rev及M13F(-21),分析結果保存一個半月。

由於核酸定序的材料、機器及其維修極為昂貴,為使本院核酸定序設施能永續支援本院各單位之研究,自民國94年起修改為收費制度,收費標準經過核心設施委員會通過。目前服務運作十分順利,深獲好評,收支亦達到平衡,去年本核心實驗室已有盈餘上繳,每年的部份定序營收轉移成隔年耗材費永續循環使用。
《文/圖:核酸定序核心實驗室蘇特立研究助理》