第 657 期 2016-07-07

研究發展
自動化次世代定序分析軟體將促進找尋家族性的罕見致病基因突變
NHRI researcher develops an automatic next-generation sequencing analysis pipeline to facilitate the identification of rare variants associated with diseases in families

次世代定序技術已成為找尋罕見致病基因突變的利器,藉由全外顯子(whole exome)甚至全基因體(whole genome)的定序,可找出患者染色體上的突變;而透過家族資料,可找出患病親屬間共有的基因突變。然而,分析次世代定序資料需要結合各種生物資訊工具、統計分析軟體及外部資料,如人類基因組參考序列資料、序列比對生物資訊軟體及連鎖分析統計分析軟體等,增加了分析上的困難度。為了簡化及加速次世代定序資料的分析,目前已有許多自動化次世代定序資料分析的流程軟體,但這些軟體功能多注重在上游的序列分析如基因型的決定等,在決定基因型後,如何快速找到患病親屬間共有的基因突變,仍是分析次世代定序家族資料的挑戰。〈更多內容〉
《文/圖:群體健康科學研究所鍾仁華副研究員》