第 733 期 2018-03-08

健康知識
微小生物的大時代—從腸道菌相看看您我的世界
The era of microbe: Understanding gut microbiota and you

什麼是微生物相（microbiota）？什麼是微生物體（microbiome）？
微生物相（microbiota）泛指「一群」棲息在植物或動物體內部與表層，或是環境中（例如土壤、深海、居住物等），肉眼看不見的微小生物。這些微小生物包括了細菌、真菌、病毒或原生生物，其與宿主之間發展出互利共生（symbiosis）、片利共生（commensalism）或致病（pathogenesis）關係。至少50年前，microbiota一詞即出現在生態學領域中，然而隨著人類疾病研究的演進與蓬勃，一般報章雜誌上的「microbiota」一詞越來越常指與人類相關的微生物相（human microbiota），甚至限縮於菌相而已（本文以下亦然）。另一方面，隨著分子生物學的巨大進展，科學家觀察微生物相的角度，從過往的培養盤篩選，得以從基因或從更細部的DNA序列進行分析。正由於體學（omics）的發展，微生物體（microbiome）一詞在2001年由微生物學家Joshua Lederberg（1958年諾貝爾獎生醫獎得主）建議使用；事實上，早在2001年之前就有「微生物體」一詞，但是直到2001年後才產生定義上的共識：凡是以「基因體」為角度論述微生物相即可稱為微生物體。無論如何，隨著高通量定序的效率和成本的大幅下降，以及蛋白質體學（proteomics）、代謝體學（metabolomics）或甚至表觀遺傳學（epigenomics）的應用，微生物相和微生物體研究爆炸性地展開，一個屬於微小生物的大時代，正式來臨。〈更多內容〉
《文/圖：免疫醫學研究中心張程翔博士後研究員、高承源副研究員》