第 458 期 2012-06-14

研究發展
GEMSiRV:全基因規模之代謝網絡建構、模擬與視覺化平台
NHRI develops GEMSiRV

全基因規模之代謝網絡模型可以用來幫助瞭解生物體的代謝能力與生物特性,因此被廣泛地應用在系統生物學的範疇中。建構全基因規模之代謝網絡通常需要一連串的推論與驗證之交互程序來進行,因此必須同時運用大量的生化、基因體知識並結合數學模型來模擬運算,然而,由於缺乏合適的媒介軟體與資料庫,代謝網絡建構的效率與其應用範疇受到侷限,本院群體健康科學研究所(生物統計與生物資訊研究組)熊昭所長、陳豐奇副研究員、廖玉潔助研究員研究團隊因此相信,藉由一個整合系統的開發,結合網絡重建、模擬與圖形化介面的功能,可以有效地促進全基因體規模之代謝網絡之建立,並幫助呈現系統生物學之概括,以期能推展並應用於解決實際的生物問題。

研究團隊針對全基因體的代謝網絡模型開發了一個軟體平台(GEMSiRV: A software platform for GEnome-scale Metabolic model Simulation, Reconstruction and Visualization),此軟體包含了3個主要的功能架構,分別是網絡重建、模型模擬與圖形化呈現。除了軟體的開發,研究團隊還提供了一個網路資源(http://sb.nhri.org.tw/GEMSiRV),整合了代謝網絡建構所需的資料,包括生化反應參考資料庫(reference databases)、過去已經發表的網絡模型(metabolic models)以及使用者自訂的代謝網絡圖(metabolic maps),藉由這些資訊的提供,使用者等同是具有網絡重建的經驗,定能加速使用者重建新物種的全基因代謝網絡並有效地加以應用。

此研究工作於2010年開始進行,成果發表於2012年的Bioinformatics期刊。
《文/圖:群體健康科學研究所生物統計與生物資訊研究組熊昭所長、陳豐奇副研究員、廖玉潔助研究員》

學術交流
2012台灣藥學會藥物化學研討會
Report on 2012 TPST Medicinal Chemistry Symposium

為推動國內新藥開發研究與生技製藥之發展,並展示藥物化學研究領域之成果及促進各專業領域間之學術交流,由台灣藥學會藥物化學組暨財團法人台北市王光昭教授學術教育基金會所舉辦之「台灣藥學會藥物化學研討會」,自1995年舉辦至今已逾17個寒暑。會中活動包含邀請國內外藥物化學領域知名學者與會演講、國內研究生及研究人員參與口頭報告與海報張貼以進行學術研討,進而相互切磋琢磨,刺激台灣藥物化學界蓬勃發展。

今年研討會由台北醫學大學藥學院(系)所承辦,自5月5至7日於溪頭自然教育園區舉行。此次會議與會團體有近20個學術機構,包含中央研究院、國家衛生研究院、國內各大化學系、藥學系、大陸首都醫科大學及北京大學之學術單位皆共襄盛舉,參加人數高達250人,亦是歷年來之最。本院生技與藥物研究所(生技藥研所)今年由謝興邦研究員與夏克山副所長帶隊,共約20餘人前往參與會議。〈更多內容〉
《文/圖:生技與藥物研究所蕭暉議博士後研究員、張許永博士後研究員》

人事動態
感染症與疫苗研究所杜鴻運助研究員升等為副研究員
Dr. Horng-Yunn Dou of the National Institute of Infectious Diseases and Vaccinology has been promoted to Associate Investigator

感染症與疫苗研究所杜鴻運博士自2012年6月起升等為專任副研究員。

杜博士於1998年取得陽明大學微生物免疫學博士學位,隨後赴美國愛恩斯坦醫學院(Albert Einstein Medical College)微生物研究所任博士後訪問學者1年,並於2002至2003年赴加拿大國家研究委員會(National Research Council Canada)生物技術研究所任訪問學者。1996至2005年杜博士也同時擔任台北市立慢性病防治醫院檢驗科主任,2005年加入本院疫苗研發中心(現為感染症與疫苗研究所)任助研究員。


杜博士為結核病專家,與分子基因醫學研究所合作,進行台灣地區不同族群(包含漢人、榮民及原住民等)的結核菌株分子流行病學與基因型別研究。〈更多內容〉
《文:編輯中心整理;圖:杜鴻運博士》

出版資訊
世界衛生組織出版「失智症:公共衛生的優先議題」
WHO publishes Dementia: a public health priority

世界衛生組織(WHO)日前出版「失智症:公共衛生的優先議題」報告。世界人口正在老化,醫療保健在上個世紀明顯地改善,平均餘命不僅增加,也活得更健康。然而,根據資料顯示,患非傳染性疾病(包括失智症)的人口也在增加。雖然失智症主要影響老年人,但是,卻不是正常老化的一部分。失智症影響所及,包括記憶、思想、行為,以及處理日常生活的能力。

失智症不僅對患者是個重擔,對於其家人與照顧者也有著莫大的壓力;它也是造成老年人失能與必須依賴他人的主要原因之一。某種程度上,在大多數的國家裡,對失智症的認識與理解皆不足,也因此造成診斷與治療上的困難,更影響了照護者、家人,以及整體社會的健康、心理與經濟。因此,失智症實不容忽視,且應該慎重地視為國家公共衛生重要的議題。此報告的目的是希望更深入認識失智症,並列為公共衛生優先議題,明確地闡述公共衛生方法以及提倡以包容、融合、平等為原則之各項行動方案。〈更多內容〉
《文:編輯中心陳筱蕾編譯;圖:出版品封面》