NHRI Communications
次世代基因體定序資料分析之序列組裝整合工具
CISA: Contig Integrator for Sequence Assembly of Bacterial Genomes
次世代基因體定序（Next Generation Sequencing, NGS）技術的快速發展，促使各研究領域積極利用次世代定序技術來進行基因解碼。因應分析NGS技術所產出的高通量之短序列，各種序列組裝工具（sequence assembler）也相繼發展，目的為加速完成全新（de novo）物種基因體序列。目前已有許多序列組裝工具能夠針對次世代基因體的序列加以組裝，然而各個基因體組裝的結果卻不盡相同，針對各個分歧的物種，沒有一個工具能夠擔保會提供最佳的組裝結果，因此本院群體健康科學研究所生物統計與生物資訊研究組廖玉潔助研究員的研究團隊開發了一個序列組裝整合工具「CISA: Contig Integrator for Sequence Assembly of Bacterial Genomes」，目的在整合各種不同組裝工具所產出的序列，找出相互吻合的序列片段，同時排除歧異度過高的序列，最後提供一組整合後的基因體序列；經過嚴謹地驗證程序檢驗，研究團隊所開發之工具確實能夠有效地整合並提升細菌基因體序列的完整性。〈更多內容〉
《文/圖：群體健康科學研究所生物統計與生物資訊研究組廖玉潔助研究員、林介華研究助理、林信宏研究助理》
世界衛生組織出版「兒童的醫院照護」手冊
WHO publishes Pocket book of hospital care for children: guidelines for the management of common childhood illnesses
世界衛生組織（WHO）日前出版「兒童的醫院照護」手冊第2版，此為2005年初版後首次更新內容，主要供照護兒童之醫護人員與衛生保健人員參考。不僅適用於住院與門診照護，醫院的基礎實驗設施與基本藥物皆可應用。
此攜帶型手冊是支援兒童疾病整合管理（Integrated Management of Childhood Illness, IMCI）的系列文件與工具之一，呈現最即時的實證臨床指引，資料更新的來源為WHO近期發表的指引與建議。指引的重點為兒童主要致死病因之管理，特別是大部分的發展中國家，如新生兒問題、肺炎、腹瀉、瘧疾、腦膜炎、敗血病、麻疹及相關症狀、嚴重急性營養不良、兒童愛滋病等。此外，手冊內容亦包括了在小型醫院可以管理的一般護理程序、病患監測與支援照護，以及一些常見手術等。
此份兒童照護指引適用於多數地區，並可適時地調整以應國情之需；內容共12章，包括：分流與急診狀況、兒童患者的診斷方法、新生兒和嬰幼兒的問題、咳嗽或呼吸困難、腹瀉、發燒、嚴重急性營養不良、兒童愛滋患者、常見手術問題、支持性照護（疼痛處理、遊玩治療）、監測兒童的進展、輔導及出院（出院時間、營養諮詢、居家照護、追蹤照護）等。文件末還有相關實務的附件，包括實務程序（注射、鼻管插入、腰椎穿刺、胸腔引流）、藥物劑量與規範、設施尺寸、營養狀態衡量、相關支援等。完整的指引可參考WHO網頁。
《文：編輯中心陳筱蕾整理；圖：出版品封面》
本院2013年4月最新研究著作
New publications by NHRI researchers
本院2013年4月各研究單位所發表的最新著作共有43篇期刊論文（詳附件清單）。
清單內之論文依研究單位筆畫分類，有興趣之讀者可從相關論文之出版平台取得全文，或本院網際網路首頁「本院簡介」之「機構典藏系統」下瀏覽相關內容。
《文：編輯中心》
2013致病性黴菌研討會
NHRI to hold 2013 Symposium of Medical Mycology
日期：2013年6月28日（星期五）
地點：國立台灣大學圖書館國際會議廳（台北市羅斯福路四段1號 圖書館 B1）
主辦單位：財團法人國家衛生研究院
國立台灣大學植物病理與微生物學系
行政院衛生署疾病管制局
財團法人謝維銓教授感染醫學文教基金會
中央研究院
本研討會提供以下學分申請：公務員學習認證、台灣感染症醫學會、台灣感染管制學會。
語言：英文 下載議程表
報名方式：e-mail: lilianfly@nhri.org.tw報名
報名日期：即日起至2013年6月5日止
報名費用：免費參加（會場備有午餐及茶點）
招收名額：100人
聯絡方式：謝小姐；電話：(037)246-166分機35526；傳真：(037)586-457
《文/圖：感染症與疫苗研究所》