第 314 期

會議報導
如何發表文章在Nature系列期刊？（二）
How to Get Published in Nature Journals？（Part II）

三、如何準備一篇好的文章？
Dr. Miller提到一個好作者通常能講一個引人入勝的故事，而一篇好的研究論文通常有3個基本要素：(1)考慮周詳的研究、(2)完善的論文準備工作、(3)具有邏輯性的論述。

(一)考慮周詳的研究
Dr. Miller表示，在做研究之前要先確認：為什麼對該議題感興趣？你想瞭解的主要問題是什麼？你的初始假設是什麼？以及要用哪些方法來測試假設、否決假設或是蒐集證據支持假設？然而，光是有假設以及有很多資料並不一定能讓研究論文獲得接受，也不一定就顯得很科學，好的研究除了要管控實驗的一些條件之外，還要重複驗證你的資料，在過程中將一些剛開始未設想到的條件逐步掌握，並重複試驗以獲得足以解答問題的結果（close open loops）。Dr. Miller指出，常常有一些有趣的好的研究論文是取材自思考周密的研究但並非全如預期的研究結果。

Dr. Miller提到規劃研究論文時還要考慮的一些現實問題，例如合作性的研究要預先討論作者排序，預先談好資料及內容分攤配比，確認作者群各自的角色，是否有資深的研究人員進行內容與資料的驗證。Nature編輯群在前幾個月對作者描述有了新的政策，要求獲得刊登的論文要提供含概每一個作者的作者群貢獻度說明（author contribution statements），使每一個作者的貢獻都獲得明確地認定。目前也有許多其他期刊會要求發表的論文要提供這樣的說明，未來集合這些說明的資料，或許可以運用一些程式將個別作者在某些領域的特殊貢獻累積起來，作為該作者除了論文發表之外的特殊專長證明文件。

Nature編輯群也對作者群中資深研究人員的角色有更明確的政策上定義，Dr. Miller指出資深人員若身為研究統籌者，必須對研究團隊的研究工作負責，也就是要確認用來發表的原始研究資料被妥善保存，並能夠隨即用來進行重新分析。資深人員還要能確認用來發表的資料是具有代表性的，也要能預先看到並降低研究資料分享時可能遭到的阻礙與困難。

Dr. Miller也提到，如果要發表論文在Nature系列期刊，Nature編輯群會要求作者將相關資料寄存在特定的資料庫裡：如果是核酸序列，可以寄存於GenBank、EMBL（European Molecular Biology Laboratory）或DDBJ（DNA Data Bank of Japan）等核酸序列資料庫；如果是DNA序列圖譜（DNA sequencing traces），可以寄存於NCBI（National Center for Biotechnology Information）的trace and short-read archive或EBI (European Bioinformatics Institute) 的Ensembl Trace Server；如果是化學結構式，可以寄存於PDB（Protein Data Bank）、SWISS-PROT、UNIPROT、Nucleic Acids Database或BMRD（Biological Magnetic Resonance Databank）等資料庫；如果是基因體資料，可以寄存於NCBI或Ensembl的基因體資料庫；如果是微陣列（microarray）資料，可以寄存於GEO（Gene Expression Omnibus）或ArrayExpress等資料庫。

此外，如果稿件被Nature系列期刊接受，表示論文的作者必須公開所有研究相關的新試驗材料（reagents）的取得途徑（例如從生技公司或其他合作伙伴）；如果相關材料的取得必須是有條件性的（例如使用費或是材料轉移合約等），這些條件必須清楚敘明。對於材料的分享上，如果Nature編輯群收到讀者的抱怨，會主動與作者聯繫尋求解釋，如果相關材料是有授權關係的，編輯群會聯繫研究的資助單位，最糟的狀況是編輯群會在發表的論文上註記這個作者將不提供試驗材料的取得資訊。

(二)完善的論文準備工作
Dr. Miller提醒作者們在提筆撰寫論文之前要先思考幾件事：(1)論文主題讓你感興趣的原因；(2)選擇一個論文撰寫的焦點；(3)你要帶給讀者的主要訊息；(4)除了論文表格的資料外，還要再三評估原始資料；(5)在研究之前的看法、已知的訊息以及已經被做過的研究；(6)你研究所得的新資料如何改變目前的看法，如何支持目前的案例，如何開拓新趨勢或新研究。

(三)具有邏輯性的論述
Dr. Miller首先強調出版在Nature系列期刊的論文內容不僅是要給專家看的，也要用初學者可以理解的方式加以表達，以便各種領域的讀者都能瞭解你想表達的重點。

1.摘要（Abstract）
摘要部分是一篇論文最常被閱讀的段落，因此摘要部分要能精確地表現你的論文重點，使讀者能夠很快地瞭解論文的大致輪廓。Dr. Miller提出撰寫摘要的一些常規，供讀者參考：(1)先以一兩句較廣泛一般性的說明來引導讀者進入研究主題，鋪設切入主題的平台，再提供更進一步的研究內容；(2)簡要說明使用的研究方法及結果；(3)描述一或兩項主要的結論；(4)描述這個研究成果對相關領域的新貢獻，對讀者有什麼重要性。

Dr. Miller提到摘要內容常會讓讀者搞迷糊的寫法包括：(1)將過去已經發表的結論與這次論文所發表的論點混淆在一起；(2)過渡解釋或過渡臆測研究結果；(3)資料或結論誤用；(4)摘要最後以多餘的說明做結尾，例如：implications for therapy are discussed，應該將明確的結論做簡要描述。

2.簡介（Introduction）
Dr. Miller表示簡介的角色就像是從一幅研究主題的風景中清理出一條小徑，讓讀者能夠順著這條小徑進入你的研究主題。她提到撰寫簡介時的一些訣竅：(1)在簡介部分的第一段描述你想嘗試解答的問題；(2)接著提供研究主題的一些背景資料；(3)將簡介聚焦在論文的主題上，為說明你的研究結果鋪路；(4)明確註記前人已做的相關研究文獻資訊，表示認同前人的研究貢獻；(5)註明正確的引用文獻資料；(6)在簡介最後描述由上述資料所得到的結論。Dr. Miller提醒撰寫期刊論文簡介時要避免長篇大論，像在寫學位論文一樣，也要避免在簡介部分提到一些與文章主題不相干的旁枝末節。

3.結果（Results）
Dr. Miller指出論文中結果文字部分的描述要與圖表的順序相呼應，文字部分一個段落只描述一個概念（concept）及一個試驗的結果，描述時可以由使用該方法的原因開始說明，再切入試驗結果，每段的最後一句話敘述從那個試驗所得到的結論，同時也使此結論可以引導出下一段的結果內容，讓讀者可以依據作者的邏輯性陳述，很快瞭解研究內容。

Dr. Miller特別說明圖表資料的重要性，好的圖表可以表達一整個故事，圖表呈現的順序也很具關鍵性。準備Nature系列期刊論文的圖表資料時，儘量讓圖表能表達豐富的訊息，儘可能呈現原始資料，如果一組資料（data point）是由幾組試驗所產生的，而資料組並不是太多，盡量呈現所有data point的原始資料，而不要僅呈現各組的平均值（average）與標準差（standard deviation）的數值，圖表的各項標示也要清楚明確。此外，圖表的選擇要小心謹慎，只在本文內放與結果內容提到的主要圖表與資料，其他輔助說明資料（例如：其他的試驗條件、其他的驗證方式、試驗材料的描述、詳細的研究方法），可以另外用線上連結的方式呈現。Dr. Miller特別提醒，投稿論文所提供的圖表千萬不要造假，因為編輯群有足夠能力判斷作者所提供的圖表及資料是否有造假的可能性。

對於統計方法使用正確性的問題，Dr. Miller建議讀者可以參考Nature期刊相關網站（ http://www.nature.com/ni/authors/submit/index.html#statistical）所列的統計方法作為檢查的清單。結果資料中要註明統計試驗的方法、樣本數、使用該統計方法的理由、α值、實際的拒絕假設機率值（P-values）。資料呈現時除了樣本數外，還要註明中間數值（例如平均數（mean）或中位數（median））、變異數值（例如標準差SD或標準誤SE）等；對於小樣本數的試驗，也可以用觀察值的區間（range）代替SD或SE值。

4.討論（Discussion）
Dr. Miller表示在討論部分要呈現整體結果所代表的意義，盡可能減少重複描述結果部分的內容。在討論部分要：(1)將現有研究的結果與前人研究的類似資料一起比較；(2)提出目前研究結果的可能解釋，並說明目前的研究未加以採納的其他假設；(3)說明目前的研究發現對於此領域與其他領域有什麼意涵。此外，在討論中如果必須用到任何未曾正式發表過的資訊（例如私下交流取得的資訊、會議摘要等），都必須附上相關資訊提供者的同意書。

5.完稿後二三事
Dr. Miller建議作者在完稿後，可以請與你不同領域的同事閱讀你的稿件，聽聽他們的看法，更正容易令人混淆的地方。此外，作者也可以從Nature系列期刊的網站上取得投稿規則、期刊政策及編審流程的相關資訊。

Dr. Miller特別提醒作者們要有心理準備，基於各種原因（例如稿件實在太多），通常他們編輯群在第一次審閱時就會刷掉65-80%的稿件，這些稿件便不會送出給外部的專家審查。因此，作者在準備稿件時要盡可能做完善的規劃，給編輯群或是指導者（advisors）的資料要盡可能完備，論文內容要盡可能讓編輯群有驚豔的感覺，進入外部審查的機率便升高了。
《文/圖：Dr. Linda Miller演講資料；編輯中心吳萃慧整理》